RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 KCNQ2O43526 872 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 ITPK1Q13572 414 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 CUL4AQ13619 759 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 TMX3Q96JJ7 454 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 EYA2O00167 538 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 ATP6V1AP38606 617 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 KCNB2Q92953 911 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 MYH3P11055 1940 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 NHSQ6T4R5 1651 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 A0A0G2JS52 829 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 NLRP10Q86W26 655 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 TICAM2Q86XR7 235 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 SPEF2Q9C093 1822 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF609O15014 1411 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 SSFA2P28290 1259 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 HAUS7Q99871 368 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 MED23Q9ULK4 1368 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 ATRNO75882 1429 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 TRAK2O60296 914 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 PTH1RQ03431 593 aa22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 FAM227BQ96M60 508 aa22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 ARXQ96QS3 562 aa22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 BTAF1O14981 1849 aa22.24■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 CSF1RP07333 972 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 NECTIN1Q15223 517 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 RASEFQ8IZ41 740 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 MAP4K1Q92918 833 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 FAM89AQ96GI7 184 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 TTC14Q96N46 770 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 BCORQ6W2J9 1755 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 A0A0D9SFI3 127 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 GPTP24298 496 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
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HCLS1-201ENST00000314583 LRRC24Q50LG9 513 aa22.21■■□□□ 1.15
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HCLS1-201ENST00000314583 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 RNF20Q5VTR2 975 aa22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.21■■□□□ 1.15
HCLS1-201ENST00000314583 CAMTA2O94983 1202 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 KCNJ4P48050 445 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 SYNE4Q8N205 404 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 SBF2Q86WG5 1849 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 A0A1B0GUL7 405 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 VPS53Q5VIR6 699 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 PSMA5P28066 241 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 AK2P54819 239 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 CTSWP56202 376 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 TIMM10P62072 90 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 AK7Q96M32 723 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-201ENST00000314583 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
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