RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 TNS3Q68CZ2 1445 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 SYCE3A1L190 88 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 MRE11P49959 708 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 HSPA4P34932 840 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 METTL24Q5JXM2 366 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 FAM173BQ6P4H8 233 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 MEGF6O75095 1541 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 MCM2P49736 904 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 PIGBQ92521 554 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 MST1RQ04912 1400 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 MTX1Q13505 466 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 BRF1Q92994 677 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.2□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 PTMSP20962 102 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ATP2B2Q01814 1243 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 FAM182BQ5T319 152 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 WDR78Q5VTH9 848 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 EYA2O00167 538 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 LARGE1O95461 756 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 GJB2P29033 226 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CHST3Q7LGC8 479 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 HIP1O00291 1037 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ANAPC15P60006 121 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 AOX1Q06278 1338 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 PSMA5P28066 241 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 H3BQV1 296 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 DDB1Q16531 1140 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 IFFO2Q5TF58 517 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CNPY2Q9Y2B0 182 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 RUFY3Q7L099 469 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 SMIM5Q71RC9 77 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 COPRSQ9NQ92 184 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 SYT1P21579 422 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 A0A1B0GUL7 405 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 C8orf37Q96NL8 207 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ATP6V1AP38606 617 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 STX6O43752 255 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 PAG1Q9NWQ8 432 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 SNAP23O00161 211 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 LMTK3Q96Q04 1460 aa7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ADORA1P30542 326 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ATP2B3Q16720 1220 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 CPLX1O14810 134 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 SLC27A2O14975 620 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 NRDCO43847 1150 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 TCIRG1Q13488 830 aa7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TMOD2-201ENST00000249700 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms