RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 LRP6O75581 1613 aa24.2■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.2■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 HSPA1LP34931 641 aa24.2■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 VPS72Q15906 364 aa24.2■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 RILPL2Q969X0 211 aa24.2■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 SIL1Q9H173 461 aa24.19■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.19■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 USP21Q9UK80 565 aa24.19■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.19■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 CASP7P55210 303 aa24.18■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa24.17■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 IL17RAQ96F46 866 aa24.16■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.16■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 H7C1W4 665 aa24.15■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 FAM184AQ8NB25 1140 aa24.15■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 STAP2Q9UGK3 403 aa24.15■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 SASH1O94885 1247 aa24.14■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 HLFQ16534 295 aa24.14■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 USP48Q86UV5 1035 aa24.14■■□□□ 1.46
VGF-201ENST00000249330 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.14■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.14■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 ATP6V1AP38606 617 aa24.13■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 TCIRG1Q13488 830 aa24.13■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 UVSSAQ2YD98 709 aa24.13■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 FAM182BQ5T319 152 aa24.13■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.13■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.12■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.12■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.12■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 FOXO4P98177 505 aa24.12■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
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VGF-201ENST00000249330 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.11■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 SIK1P57059 783 aa24.11■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.11■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.11■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 CHMP3Q9Y3E7 222 aa24.11■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 AOX1Q06278 1338 aa24.1■■□□□ 1.45
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VGF-201ENST00000249330 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.1■■□□□ 1.45
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VGF-201ENST00000249330 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.09■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 KCNQ4P56696 695 aa24.08■■□□□ 1.45
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VGF-201ENST00000249330 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 HSPA4P34932 840 aa24.08■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 FAM89AQ96GI7 184 aa24.08■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
VGF-201ENST00000249330 PALLDQ8WX93 1383 aa24.08■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 SYNE4Q8N205 404 aa24.07■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 COPRSQ9NQ92 184 aa24.07■■□□□ 1.44
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VGF-201ENST00000249330 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 TJP1Q07157 1748 aa24.06■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
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VGF-201ENST00000249330 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 COL15A1P39059 1388 aa24.06■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 TCHHQ07283 1943 aa24.06■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.05■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 AFF2P51816 1311 aa24.05■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.04■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.03■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.03■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 ADCY5O95622 1261 aa24.03■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 IL25Q9H293 177 aa24.03■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 UBE2HP62256 183 aa24.02■■□□□ 1.44
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