RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641658.1

MFSD8-240, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 1,731 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-240	ENST00000641658	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GGN	Q86UU5	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	RNF138	Q8WVD3	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	MARK4	Q96L34	752 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	EQTN	Q9NQ60	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	SENP1	Q9P0U3	644 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	CUBN	O60494	3623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658		H3BQF6	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	UPK1A	O00322	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	PLOD3	O60568	738 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	IGKV1D-16	P01601	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	KRT6A	P02538	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	KRT6B	P04259	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	CRYGS	P22914	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GCA	P28676	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	HMOX2	P30519	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	KRT6C	P48668	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62	6e-10	■□□□□ 11.1
MFSD8-240	ENST00000641658	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	ACKR1	Q16570	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	FBXO30	Q8TB52	745 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658		M0R3H8	397 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	MGST3	O14880	152 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	ARHGEF9	O43307	516 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	UTS2	O95399	124 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	PEPD	P12955	493 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	IL11	P20809	199 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	FPR3	P25089	353 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GABRA3	P34903	492 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	PTH2R	P49190	550 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	SERPINB9	P50453	376 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	VSNL1	P62760	191 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	HSPB3	Q12988	150 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	RASA2	Q15283	850 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	SGCB	Q16585	318 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	FMO2	Q99518	471 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	RNF122	Q9H9V4	155 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-240	ENST00000641658	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		4.9	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms