RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 ZIM3Q96PE6 472 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SORCS2Q96PQ0 1159 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR14Q9BWN1 585 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CHODLQ9H9P2 273 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 MOKQ9UQ07 419 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 TMED7Q9Y3B3 224 aa9□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 AP3D1O14617 1153 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SPAG7O75391 227 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 WNT11O96014 354 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 TACR3P29371 465 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 KHKP50053 298 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP2K6P52564 334 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 HPCAP84074 193 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 GPAT3Q53EU6 434 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM120AOSQ5T036 256 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CMIPQ8IY22 773 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 NEURL3Q96EH8 262 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 DPY30Q9C005 99 aa8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 AGAP5A6NIR3 686 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 HMGN4O00479 90 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 FAAHO00519 579 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 KLF11O14901 512 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 BPGMP07738 259 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT17P0C025 328 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 HNF1AP20823 631 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC1A3P43003 542 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CASP8Q14790 479 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 AAED1Q7RTV5 226 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM99Q8N816 258 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 POMGNT2Q8NAT1 580 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 TESCQ96BS2 214 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 C3orf49Q96BT1 292 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXN4Q96NZ1 517 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CA10Q9NS85 328 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 LGALS13Q9UHV8 139 aa8.98□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 LIPT2A6NK58 231 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 AQP7P3A6NL99 342 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE5AO76074 875 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 AKR7A3O95154 331 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 C1QCP02747 245 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 GPIP06744 558 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CHRM4P08173 479 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CREB1P16220 341 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF23P17027 643 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 PAX7P23759 505 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SERPINF1P36955 418 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ETV4P43268 484 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 EPS8Q12929 822 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 CEACAM7Q14002 265 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 OR7A5Q15622 319 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SYPL1Q16563 259 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SPANXN4Q5MJ08 99 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF781Q8N8C0 355 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKFN1Q8N957 763 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.97□□□□□ -0.97
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms