RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 PRPS1P60891 318 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFBR3Q03167 851 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SMU1Q2TAY7 513 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 HIKESHIQ53FT3 197 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM166AQ6J272 317 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NEURL3Q96EH8 262 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 DPY30Q9C005 99 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP7Q9Y680 259 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 HPCAP84074 193 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM120AOSQ5T036 256 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PAQR6Q6TCH4 344 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKFN1Q8N957 763 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ZIC4Q8N9L1 334 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM45BQ96B21 275 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PIMREGQ9BSJ6 248 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGN4O00479 90 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 KLF11O14901 512 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ITM2AO43736 263 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 C8BP07358 591 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NUDT17P0C025 328 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL24Q6TFL4 600 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PMM1Q92871 262 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf49Q96BT1 292 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35A5Q9BS91 424 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A1Q9H2H9 487 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP5A6NIR3 686 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFS8O00217 210 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 WNT11O96014 354 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRM4P08173 479 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ETV4P43268 484 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP8Q14790 479 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SYPL1Q16563 259 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SPANXN4Q5MJ08 99 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 AAED1Q7RTV5 226 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CMIPQ8IY22 773 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM99Q8N816 258 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF781Q8N8C0 355 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKS4BQ8N8V4 417 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 OR9K2Q8NGE7 335 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TESCQ96BS2 214 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXN4Q96NZ1 517 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ZIM3Q96PE6 472 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ANK2Q01484 3957 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR7A3O95154 331 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 APEHP13798 732 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC1A3P43003 542 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CEACAM7Q14002 265 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CARTPTQ16568 116 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF130Q86XS8 419 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 BOD1Q96IK1 185 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 FAAHO00519 579 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS3BPQ08380 585 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 EPS8Q12929 822 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 POMGNT2Q8NAT1 580 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 LIPT2A6NK58 231 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TYROBPO43914 113 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINF1P36955 418 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7A5Q15622 319 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 TBRG1Q3YBR2 411 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC38A2Q96QD8 506 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX7Q9BT81 388 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAM19Q9H013 955 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 CA10Q9NS85 328 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-211ENST00000590874 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP73A6NFT4 308 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP7P3A6NL99 342 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 HAX1O00165 279 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 LGI1O95970 557 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 GPIP06744 558 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP2K6P52564 334 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 ADIPOQQ15848 244 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA19Q7Z5L4 167 aa22.32■■□□□ 1.16
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