RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576557.1

ABCC1-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily C member 1, human

TSL 4

Gene ABCC1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCC1-208	ENST00000576557	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		10.85	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557		A0A1W2PNR3	127 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	SHISA9	B4DS77	424 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	HMGN4	O00479	90 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	BMP2	P12643	396 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	ETFA	P13804	333 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	MATN1	P21941	496 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC6A2	P23975	617 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	EDNRA	P25101	427 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	MNAT1	P51948	309 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC7A2	P52569	658 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	CDH11	P55287	796 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	DSTN	P60981	165 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	RGN	Q15493	299 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	HTRA1	Q92743	480 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	NSL1	Q96IY1	281 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	PIGU	Q9H490	435 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ABCC1-208	ENST00000576557	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557		A0A1W2PQD3	144 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	EVPLL	A8MZ36	301 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ABCD4	O14678	606 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	AGR2	O95994	175 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	AK1	P00568	194 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	OR12D1	P0DN82	309 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	GPX2	P18283	190 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	CRAT	P43155	626 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	OR3A2	P47893	321 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	NUDT6	P53370	316 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	PSME3	P61289	254 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	MXRA7	P84157	204 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	BNIP1	Q12981	228 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	PPA1	Q15181	289 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	DCST2	Q5T1A1	773 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	C16orf89	Q6UX73	402 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	RAB8B	Q92930	207 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF524	Q96C55	264 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	BTBD2	Q9BX70	525 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	CMTM6	Q9NX76	183 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	NDE1	Q9NXR1	346 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557		A0A096LNT2	108 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	DUXA	A6NLW8	204 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	GJE1	A6NN92	205 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	NME4	O00746	187 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	NUDT7	P0C024	238 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	FAM157C	P0CG43	387 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ARAF	P10398	606 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ATP6V1C1	P21283	382 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ELK4	P28324	431 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC7A1	P30825	629 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	LCN1	P31025	176 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	P2RX1	P51575	399 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	HPCA	P84074	193 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC25A3	Q00325	362 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	NRF1	Q16656	503 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	CYP51A1	Q16850	503 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	AGAP6	Q5VW22	663 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	RINL	Q6ZS11	566 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557		Q6ZT83	130 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	SERPINA11	Q86U17	422 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ZNF614	Q8N883	585 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	GPR119	Q8TDV5	335 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	MAL2	Q969L2	176 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ABCC1-208	ENST00000576557	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68

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