RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 TIGARQ9NQ88 270 aa7.32□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 KLHL13Q9P2N7 655 aa7.32□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.32□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 PROCRQ9UNN8 238 aa7.32□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 IFT52Q9Y366 437 aa7.32□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CAPN7Q9Y6W3 813 aa7.32□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 M0QX08 132 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 FXYD1O00168 92 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 PRKD3O94806 890 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 MFN2O95140 757 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CRHP06850 196 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 IMPDH2P12268 514 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 FCGR2AP12318 317 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 POU2F1P14859 743 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 ETS2P15036 469 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 FPR1P21462 350 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 DRD4P21917 467 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CXCR1P25024 350 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 HTR2AP28223 471 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 AGTR1P30556 359 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 SSTR2P30874 369 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 LSP1P33241 339 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 SLC1A3P43003 542 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 GZMMP51124 257 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 RAC3P60763 192 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 TSC22D1Q15714 1073 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 RNF220Q5VTB9 566 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 SPATA21Q7Z572 469 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 P3H2Q8IVL5 708 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 C11orf65Q8NCR3 313 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 HIPK4Q8NE63 616 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 RNF128Q8TEB7 428 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 PMM1Q92871 262 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 RCN3Q96D15 328 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 C14orf79Q96F83 325 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 LURAP1Q96LR2 239 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 GMEB1Q9Y692 573 aa7.31□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 FBN2P35556 2912 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 GMNCA6NCL1 334 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 M0R3H8 397 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 AIM2O14862 343 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 TPST2O60704 377 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CYTIPO60759 359 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 AKR7A3O95154 331 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 IGHV3-9P01782 118 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CD8BP10966 210 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 COX4I1P13073 169 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CBLP22681 906 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 PRKAR1BP31321 381 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CCKARP32238 428 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 NTF4P34130 210 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CD79BP40259 229 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 HTR3AP46098 478 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 COPZ1P61923 177 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CEACAM7Q14002 265 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 OR7A5Q15622 319 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 DUSP7Q16829 419 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 ALKBH2Q6NS38 261 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 KRT73Q86Y46 540 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 KIF18BQ86Y91 864 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 OR4D11Q8NGI4 311 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 OR6K3Q8NGY3 331 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 C3orf49Q96BT1 292 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 DDIT4LQ96D03 193 aa7.3□□□□□ -1.24
LINS1-211ENST00000560941 ECSITQ9BQ95 431 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms