RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 VSTM5A8MXK1 200 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 F5H5P2 479 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CLIC1O00299 241 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 BCKDHAP12694 445 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PSMB6P28072 239 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 GABRA5P31644 462 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 MMP15P51511 669 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 NRG3P56975 720 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 ERVFC1-1P60608 527 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 EFNB1P98172 346 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 INSL4Q14641 139 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 HERPUD1Q15011 391 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 HAGHQ16775 308 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 DHRS11Q6UWP2 260 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 LAPTM4BQ86VI4 370 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 OR5D18Q8NGL1 313 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CDS1Q92903 461 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2M4Q96R27 311 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PCBD2Q9H0N5 130 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 DVL1O14640 695 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 INSIG1O15503 277 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PSMD10O75832 226 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 RLN1P04808 185 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 HSD3B2P26439 372 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CDH11P55287 796 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 OR5I1Q13606 314 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PRAMEF20Q5VT98 475 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 ATG9BQ674R7 924 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 NTNG2Q96CW9 530 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM185BQ9H7F4 350 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 FN3KRPQ9HA64 309 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A087WZ62 844 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 TYRP1P17643 537 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 MAPK9P45984 424 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 NOVP48745 357 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 ART1P52961 327 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 TMPPEQ6ZT21 453 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PTCHD4Q6ZW05 846 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 TERB2Q8NHR7 220 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 MYEOVQ96EZ4 313 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PRRX2Q99811 253 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 WDR18Q9BV38 432 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 NIF3L1Q9GZT8 377 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 ALG9Q9H6U8 611 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PADI1Q9ULC6 663 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 FZD10Q9ULW2 581 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 AKT3Q9Y243 479 aa10.2□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 FGBP02675 491 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 GIMD1P0DJR0 217 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PDX1P52945 283 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 ATP6V1FQ16864 119 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 BTNL3Q6UXE8 466 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 MCEMP1Q8IX19 187 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 M1APQ8TC57 530 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CORO2AQ92828 525 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CDK15Q96Q40 435 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 RHOFQ9HBH0 211 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 HEBP1Q9NRV9 189 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 FTSJ1Q9UET6 329 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 SUSD2Q9UGT4 822 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 BLACEA4D250 179 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 SCN2BO60939 215 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CD5P06127 495 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 ANXA5P08758 320 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 RAC3P60763 192 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CDC42P60953 191 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 IL10RAQ13651 578 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 KCTD11Q693B1 232 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF567Q8N184 647 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2V1Q8NHB1 315 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM151AQ8WW52 585 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SEMA4B-204ENST00000558065 CISHQ9NSE2 258 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms