RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 ELMO1Q92556 727 aa4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 OR5M11Q96RB7 305 aa4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TBX15Q96SF7 602 aa4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 SOSTQ9BQB4 213 aa4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PPA2Q9H2U2 334 aa4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa4.01□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 L7N2F9 121 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 GPAA1O43292 621 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 SLC35E2P0CK97 266 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TNNI1P19237 187 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 CHMLP26374 656 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 ANXA13P27216 316 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 CALCRP30988 508 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 GCKP35557 465 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 VHLP40337 213 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 CDH6P55285 790 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 CD47Q08722 323 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PPIL2Q13356 520 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 ASAH1Q13510 395 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 SERTAD2Q14140 314 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 DGUOKQ16854 277 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 LRRC31Q6UY01 552 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 GDPD3Q7L5L3 318 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 HPS6Q86YV9 775 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 BBOF1Q8ND07 529 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 OR4F6Q8NGB9 312 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 ZPLD1Q8TCW7 415 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 UFD1Q92890 307 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 HAVCR1Q96D42 359 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 OXGR1Q96P68 337 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 RANBP9Q96S59 729 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 C11orf70Q9BRQ4 267 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 MIEF1Q9NQG6 463 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 KIAA1257Q9ULG3 409 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PLLPQ9Y342 182 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 CACNA1FO60840 1977 aa4□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 OR2AG2A6NM03 316 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 H0YC42 278 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 DCTN6O00399 190 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PI15O43692 258 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 DFNA5O60443 496 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 SLITRK3O94933 977 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 FTH1P02794 183 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 MMP1P03956 469 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 P04436 131 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 IGLL1P15814 213 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 AZU1P20160 251 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 IL12AP29459 219 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 IL2RGP31785 369 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 IST1P53990 364 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PKNOX1P55347 436 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 C21orf59P57076 290 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 GNMTQ14749 295 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TGIF1Q15583 401 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PRR4Q16378 134 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 QRICH1Q2TAL8 776 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 CLEC2AQ6UVW9 174 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 MFSD6LQ8IWD5 586 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PEX13Q92968 403 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 SLC38A4Q969I6 547 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 PANX2Q96RD6 677 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 MBOAT4Q96T53 435 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 APOL2Q9BQE5 337 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 TMCO1Q9UM00 188 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 STARD10Q9Y365 291 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 NINLQ9Y2I6 1382 aa3.99□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 SH3TC1Q8TE82 1336 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 POGZQ7Z3K3 1410 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 OR5B21A6NL26 309 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 GFYI3L273 518 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 CT62P0C5K7 136 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 FOLR2P14207 255 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 NPR2P20594 1047 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 SLC25A1P53007 311 aa3.98□□□□□ -1.77
USP15-218ENST00000552346 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms