RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	DPP10	Q8N608	796 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	ZNF611	Q8N823	705 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	MAL2	Q969L2	176 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	TMEM45B	Q96B21	275 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	VAPA	Q9P0L0	249 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	PRSS50	Q9UI38	385 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	ZFHX3	Q15911	3703 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CS-223	ENST00000551137	ZAN	Q9Y493	2812 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PDLIM1	O00151	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	HS3ST1	O14792	307 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RAMP1	O60894	148 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SMPD2	O60906	423 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SASH3	O75995	380 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	VAMP5	O95183	116 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	IGHV1-2	P23083	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ADRM1	Q16186	407 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	AGK	Q53H12	422 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SERPINA11	Q86U17	422 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CCDC103	Q8IW40	242 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	STK35	Q8TDR2	534 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	APH1A	Q96BI3	265 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C3orf49	Q96BT1	292 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	MUS81	Q96NY9	551 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	GSX2	Q9BZM3	304 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	AQP7P3	A6NL99	342 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	EVPLL	A8MZ36	301 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NR5A2	O00482	541 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	LYZL6	O75951	148 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PLAU	P00749	431 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	GGT1	P19440	569 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CCNA2	P20248	432 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	IDUA	P35475	653 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	P2RY4	P51582	365 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CDK6	Q00534	326 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	KRT73	Q86Y46	540 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CCL19	Q99731	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ASB6	Q9NWX5	421 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DPRX	A6NFQ7	191 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	FRS3	O43559	492 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	CD3E	P07766	207 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	DANCR	P0C864	163 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CS-223	ENST00000551137	EGR4	Q05215	589 aa		10.12	□□□□□ -0.79

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