RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547374.5

BRF1-210, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5

Gene BRF1, Length 3,809 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-210	ENST00000547374	CTSB	P07858	339 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	NDUFS1	P28331	727 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	PTGS2	P35354	604 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	IGFALS	P35858	605 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ERVK-21	P61565	698 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	SIRPA	P78324	504 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	TNFRSF17	Q02223	184 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF85	Q03923	595 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	BMPER	Q8N8U9	685 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	SFXN5	Q8TD22	340 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	YIPF5	Q969M3	257 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374		Q96M85	177 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF681	Q96N22	645 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	CSTA	P01040	98 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	IL9	P15248	144 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	GAS6	Q14393	721 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	BEX5	Q5H9J7	111 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	MOAP1	Q96BY2	351 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	PELI1	Q96FA3	418 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		11.97	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	CA3	P07451	260 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	EPX	P11678	715 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	PLA1A	Q53H76	456 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	TCTE1	Q5JU00	501 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	OOSP2	Q86WS3	158 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	FAM3C	Q92520	227 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	DAPP1	Q9UN19	280 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	MPDZ	O75970	2070 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	PRSS38	A1L453	326 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	RAF1	P04049	648 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	NID1	P14543	1247 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	AQP2	P41181	271 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	PITPNA	Q00169	270 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF563	Q8TA94	476 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
BRF1-210	ENST00000547374	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	URAD	A6NGE7	173 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	SPDEF	O95238	335 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	EFNB1	P98172	346 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	GPR18	Q14330	331 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	GIMAP5	Q96F15	307 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	NOX3	Q9HBY0	568 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	PHF11	Q9UIL8	331 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.96	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	ADAM11	O75078	769 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	PTH2R	P49190	550 aa		11.95	□□□□□ -0.5
BRF1-210	ENST00000547374	ENPP2	Q13822	863 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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