RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530008.1

CAPRIN1-208, Transcript of cell cycle associated protein 1, human

TSL 4

Gene CAPRIN1, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPRIN1-208	ENST00000530008	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	GPR65	Q8IYL9	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ZNF254	O75437	659 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	STS	P08842	583 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	NPR2	P20594	1047 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	IL12A	P29459	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	HTR1F	P30939	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	MERTK	Q12866	999 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TGIF1	Q15583	401 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	RASL10A	Q92737	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	HIP1	O00291	1037 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	DCTN6	O00399	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	GPAA1	O43292	621 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	PI15	O43692	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	UGT1A9	O60656	530 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TOM1	O60784	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	H6PD	O95479	791 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	VDAC1	P21796	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	PLK1	P53350	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	BID	P55957	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	CXCL6	P80162	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	CD47	Q08722	323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ASAH1	Q13510	395 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	OR5I1	Q13606	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	DGUOK	Q16854	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	COMMD1	Q8N668	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	RNF126	Q9BV68	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	DLGAP1	O14490	977 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	OR7A10	O76100	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	C1orf105	O95561	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	STAMBP	O95630	424 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	RALB	P11234	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	IGLL1	P15814	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	ZNF43	P17038	809 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	GNMT	Q14749	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	TGFBI	Q15582	683 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPRIN1-208	ENST00000530008	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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