RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524238.3

HMBOX1-211, Transcript of homeobox containing 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HMBOX1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 FCRLAQ7L513 359 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC35F3Q8IY50 421 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 BEST3Q8N1M1 668 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 OR2L2Q8NH16 312 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 OR5J2Q8NH18 312 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TMEM239Q8WW34 195 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 FOXJ1Q92949 421 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ARL11Q969Q4 196 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 VOPP1Q96AW1 172 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CASD1Q96PB1 797 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 DPH1Q9BZG8 443 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MED20Q9H944 212 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 APMAPQ9HDC9 416 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 KLK11Q9UBX7 282 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 EDARQ9UNE0 448 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ASF1AQ9Y294 204 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MED31Q9Y3C7 131 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.95□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GLTPD2A6NH11 291 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PIP5K1CO60331 668 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TACSTD2P09758 323 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 GKN3PP0CG01 181 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CKBP12277 381 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 FOLR2P14207 255 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CDK2P24941 298 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PAX6P26367 422 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 DCTDP32321 178 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 HCCSP53701 268 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC7A9P82251 487 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 DUSP8Q13202 625 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 COL19A1Q14993 1142 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CEBPEQ15744 281 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 C4orf46Q504U0 113 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF805Q5CZA5 627 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 HES5Q5TA89 166 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 THAP6Q8TBB0 222 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 RPS4Y2Q8TD47 263 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC39A7Q92504 469 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 OTUB2Q96DC9 234 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PELI1Q96FA3 418 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 LMLNQ96KR4 655 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 OR14A2Q96R54 314 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SEC11CQ9BY50 192 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 LINC00597Q9H2U6 94 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 C1orf198Q9H425 327 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 NOX4Q9NPH5 578 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 LHX9Q9NQ69 397 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 C5AR2Q9P296 337 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 TAC3Q9UHF0 121 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 WDR45Q9Y484 360 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa6.94□□□□□ -1.3
HMBOX1-211ENST00000524238 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms