RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NRMQ8IXM6 262 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GPR32P1Q8NGA4 272 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PIGKQ92643 395 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FAM122AQ96E09 287 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 BEX2Q9BXY8 128 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NUDT15Q9NV35 164 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 UBQLN2Q9UHD9 624 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GVT2 93 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC22A23A1A5C7 686 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 EFCAB9A8MZ26 197 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OSMP13725 252 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FPR3P25089 353 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ITPKBP27987 946 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RAD52P43351 418 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LSSP48449 732 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CRYBA2P53672 197 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 COL28A1Q2UY09 1125 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 EIPR1Q53HC9 387 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FCRL6Q6DN72 434 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR10J5Q8NHC4 309 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SFXN5Q8TD22 340 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NDC1Q9BTX1 674 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 Q9N2J8 555 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 HYKKA2RU49 373 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 METTL12A8MUP2 240 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RLN2P04090 185 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SMSP52788 366 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RAB25P57735 213 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GABARAPL2P60520 117 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NCS1P62166 190 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 HFEQ30201 348 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 VASNQ6EMK4 673 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM64Q6YI46 380 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GHDCQ8N2G8 530 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CDRT4Q8N9R6 151 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NDNFQ8TB73 568 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJA3Q96EY1 480 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35A4Q96G79 324 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 LRR1Q96L50 414 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 AICDAQ9GZX7 198 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GRHPRQ9UBQ7 328 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CLCA1A8K7I4 914 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 REM1O75628 298 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TSPAN19P0C672 248 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 CRABP1P29762 137 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SSTR4P31391 388 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 KIR3DL2P43630 455 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 GAS6Q14393 721 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF404Q494X3 552 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 DCST2Q5T1A1 773 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf185Q5T7R7 199 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP40Q5TG30 622 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF511Q8NB15 262 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR56B2PQ8NGI1 322 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 OR51A7Q8NH64 312 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF675Q8TD23 568 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 FAR1Q8WVX9 515 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM203Q969S6 136 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms