RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	C12orf10	Q9HB07	376 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	VAMP5	O95183	116 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ACKR1	Q16570	336 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	C3orf49	Q96BT1	292 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	MUCL1	Q96DR8	90 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	SH3GL1	Q99961	368 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	TRIM2	Q9C040	744 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	LIPT2	A6NK58	231 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	AHSA1	O95433	338 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	PNMT	P11086	282 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	IMPDH2	P12268	514 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	PRG2	P13727	222 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	CEACAM7	Q14002	265 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	OR7A5	Q15622	319 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC103	Q8IW40	242 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ELOA3	Q8NG57	546 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ASB6	Q9NWX5	421 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	PRSS50	Q9UI38	385 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	SIAH2	O43255	324 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	KLF4	O43474	513 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	GGT1	P19440	569 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	KLK2	P20151	261 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	MMEL1	Q495T6	779 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM225	Q6GV28	225 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	CASP12	Q6UXS9	341 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	PIP5K1A	Q99755	562 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CNOT7-204	ENST00000518885	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	OR2T1	O43869	369 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	LYZL6	O75951	148 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	NPPA	P01160	153 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	COX5A	P20674	150 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC17A1	Q14916	467 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	COQ5	Q5HYK3	327 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	CCL19	Q99731	98 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	UPB1	Q9UBR1	384 aa		21.39	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885		A0A1W2PPR1	153 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	CIB4	A0PJX0	185 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	AQP7P3	A6NL99	342 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	FRS3	O43559	492 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	CD53	P19397	219 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	MTPN	P58546	118 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	TGFBR3	Q03167	851 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	TAB1	Q15750	504 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	STK11	Q15831	433 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ADRM1	Q16186	407 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ULK3	Q6PHR2	472 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	MALT1	Q9UDY8	824 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	RASD1	Q9Y272	281 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		21.38	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ARHGEF9	O43307	516 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	ATP8B1	O43520	1251 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	SMPD2	O60906	423 aa		21.37	■■□□□ 1.01
CNOT7-204	ENST00000518885	TMCC2	O75069	709 aa		21.37	■■□□□ 1.01

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