RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CEACAM7Q14002 265 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10A6Q8NH74 314 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGXQ8TBF5 258 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ROS1P08922 2347 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GWA3 101 aa16.55■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 CASKO14936 926 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 DNPH1O43598 174 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TPST2O60704 377 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 NPIPB7O75200 414 aa16.55■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 MFN2O95140 757 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 GOSR1O95249 250 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ATE1O95260 518 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ART1P52961 327 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYBA2P53672 197 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC16A1P53985 500 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35A1P78382 337 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT5Q7Z7M9 940 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT73Q86Y46 540 aa16.55■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC8Q8IUR7 673 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM99Q8N816 258 aa16.55■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 PTDSS2Q9BVG9 487 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.55■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 SEC14L4Q9UDX3 406 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAPPC4Q9Y296 219 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV1-2P23083 117 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PCGF2P35227 344 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 P2RY4P51582 365 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PDK3Q15120 406 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSWIM7Q19AV6 140 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SFRP5Q5T4F7 317 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf140Q5VVS0 124 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ALKBH2Q6NS38 261 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 NANOGP8Q6NSW7 305 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZT83 130 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 P3H2Q8IVL5 708 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35B4Q969S0 331 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TAMM41Q96BW9 452 aa16.54■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 NANOGQ9H9S0 305 aa16.54■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CASP12Q6UXS9 341 aa16.53■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF607Q96SK3 696 aa16.53■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 AQP7P3A6NL99 342 aa16.52■□□□□ 0.24
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SH3BP2-218ENST00000511185 RAF1P04049 648 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 GPIP06744 558 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CD247P20963 164 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 IL32P24001 234 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 RPS5P46782 204 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 MAP2K6P52564 334 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC17A1Q14916 467 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 TAB1Q15750 504 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 DUSP7Q16829 419 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 MMEL1Q495T6 779 aa16.52■□□□□ 0.24
SH3BP2-218ENST00000511185 COQ5Q5HYK3 327 aa16.52■□□□□ 0.24
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