RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496384.6

BRAF-204, Transcript of B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase, humanhuman

TSL 5

Gene BRAF, Length 8,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAF-204ENST00000496384 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 OR14A16Q8NHC5 309 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 FIBINQ8TAL6 211 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 RNF138Q8WVD3 245 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 MOAP1Q96BY2 351 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 SLC35A4Q96G79 324 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TMEM185BQ9H7F4 350 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ZNF236Q9UL36 1845 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 MSTNO14793 375 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 HSMCR30P0CW71 290 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 HTR2AP28223 471 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 AQP1P29972 269 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 HSD17B2P37059 387 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 VEGFCP49767 419 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PYY3Q5JQD4 70 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 SLC25A25Q6KCM7 469 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 MED27Q6P2C8 311 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PPCDCQ96CD2 204 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PDE7BQ9NP56 450 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 HSPB2A8KAH6 182 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PIP5K1CO60331 668 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 AKR7A3O95154 331 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 CKMP06732 381 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 DCTDP32321 178 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 HSPB2Q16082 182 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PCK2Q16822 640 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 CDNFQ49AH0 187 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 GLT8D1Q68CQ7 371 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 VITQ6UXI7 678 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 C17orf107Q6ZR85 190 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 OR8H3Q8N146 312 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 OR2A1Q8NGT9 310 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ZNF721Q8TF20 911 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 HASPINQ8TF76 798 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TCEAL4Q96EI5 215 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 AQP10Q96PS8 301 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 AMDHD2Q9Y303 409 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 A0A1W2PPE3 182 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 F5H5T6 163 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 SPINT3P49223 89 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 OR10A3P58181 314 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 CD81P60033 236 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 AMER3Q8N944 861 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 OR5AK2Q8NH90 309 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ASB5Q8WWX0 329 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 MED10Q9BTT4 135 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PTPRFP10586 1907 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 A0A0A6YYH2 397 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 CDHR4A6H8M9 788 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 A6NJ64 397 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 SLC22A31A6NKX4 558 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TEX46H3BTG2 121 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TLE2Q04725 743 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TSC22D1Q15714 1073 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TRIM60Q495X7 471 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ACSM3Q53FZ2 586 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 MFSD12Q6NUT3 480 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 OLIG3Q7RTU3 272 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 TCEAL8Q8IYN2 117 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 GHSRQ92847 366 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 OTULINQ96BN8 352 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 FERD3LQ96RJ6 166 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 ADAM12O43184 909 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 EFSO43281 561 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PMS2P2O95744 297 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 RHOCP08134 193 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 DGKEP52429 567 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 PITPNAQ00169 270 aa4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
BRAF-204ENST00000496384 KLHL12Q53G59 568 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms