RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LRRC61Q9BV99 259 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IL20Q9NYY1 176 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SEC14L4Q9UDX3 406 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JNG1 304 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 AGR2O95994 175 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LALBAP00709 142 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LIMS3P0CW19 117 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LIMS4P0CW20 117 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MAKP20794 623 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TNFSF8P32971 234 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 WNT4P56705 351 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 BTG2P78543 158 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 STX4Q12846 297 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 INSL4Q14641 139 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DS5Q14953 304 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DECR1Q16698 335 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PGGHGQ32M88 737 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FHL5Q5TD97 284 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF620Q6ZNG0 422 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LAX1Q8IWV1 398 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR8H3Q8N146 312 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OSTF1Q92882 214 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR52D1Q9H346 318 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 UBQLN3Q9H347 655 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LYRM4Q9HD34 91 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 STUB1Q9UNE7 303 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF175Q9Y473 711 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SNX4O95219 450 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CBX7O95931 251 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ATP1B1P05026 303 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IL7P13232 177 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NID1P14543 1247 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZNF250P15622 560 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CELP19835 753 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FPR3P25089 353 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SDC2P34741 201 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TALDO1P37837 337 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GAS1P54826 345 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 EFNB1P98172 346 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 RUNX1T1Q06455 604 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DUSP8Q13202 625 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ELOCQ15369 112 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NDUFAF6Q330K2 333 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 GHDCQ8N2G8 530 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CYB561A3Q8NBI2 242 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR2T33Q8NG76 320 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 LMX1AQ8TE12 382 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 C12orf57Q99622 126 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TMED9Q9BVK6 235 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 NTMQ9P121 344 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SLC35F4A4IF30 521 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 FITM1A5D6W6 292 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 CDHR4A6H8M9 788 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SURF4O15260 269 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 SSX4O60224 188 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 PLOD3O60568 738 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ADAM11O75078 769 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 REM1O75628 298 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 DBIP07108 87 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 IFI6P09912 130 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC4-211ENST00000492996 MAOAP21397 527 aa6.44□□□□□ -1.38
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