RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403	LGI1	O95970	557 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	FES	P07332	822 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	EPX	P11678	715 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	CD99	P14209	185 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	MNAT1	P51948	309 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	DUSP7	Q16829	419 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	COMTD1	Q86VU5	262 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	KIF18B	Q86Y91	864 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ELOA3	Q8NG57	546 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	GPR32P1	Q8NGA4	272 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	RNF217	Q8TC41	542 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	RNF128	Q8TEB7	428 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	C3orf49	Q96BT1	292 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ARL5B	Q96KC2	179 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ARHGDIG	Q99819	225 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	FOXC2	Q99958	501 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ADA2	Q9NZK5	511 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	JKAMP	Q9P055	326 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	BAG5	Q9UL15	447 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	SLC9A8	Q9Y2E8	581 aa		13.12	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403		A0A1B0GWA3	101 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403		A8MVM7	634 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403		M0R3H8	397 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	NME4	O00746	187 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	MSTN	O14793	375 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	DNPH1	O43598	174 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	PNMT	P11086	282 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	CD247	P20963	164 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	DNASE1	P24855	282 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	KDELR2	P33947	212 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	IDUA	P35475	653 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	SLC35A1	P78382	337 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	MXRA7	P84157	204 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	KRT72	Q14CN4	511 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	NRF1	Q16656	503 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	VWA1	Q6PCB0	445 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	MED12L	Q86YW9	2145 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ABHD3	Q8WU67	409 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	STARD4	Q96DR4	205 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	MCHR1	Q99705	422 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ALG2	Q9H553	416 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	C12orf10	Q9HB07	376 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	GP6	Q9HCN6	339 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	NDE1	Q9NXR1	346 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	PROCR	Q9UNN8	238 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ACAN	P16112	2415 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	ZC3H12D	A2A288	527 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403		A8MXE2	369 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	FMO6P	O60774	539 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	GPI	P06744	558 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	HTR2A	P28223	471 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	GSK3B	P49841	420 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	BNIP2	Q12982	314 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	GUSBP1	Q15486	140 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	PIGX	Q8TBF5	258 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	LZIC	Q8WZA0	190 aa		13.1	□□□□□ -0.31
NOP58-208	ENST00000488403	PRR14	Q9BWN1	585 aa		13.1	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms