RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 DCAF12Q5T6F0 453 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 HES3Q5TGS1 186 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ULK3Q6PHR2 472 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 B3GLCTQ6Y288 498 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SHFQ7M4L6 423 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 DEFB124Q8NES8 71 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 OR13F1Q8NGS4 319 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 TMEM163Q8TC26 289 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 FANK1Q8TC84 345 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 CT55Q8WUE5 264 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 LPAR4Q99677 370 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 NPAS1Q99742 590 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 CMKLR1Q99788 373 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF426Q9BUY5 554 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 STRADBQ9C0K7 418 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 LAT2Q9GZY6 243 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 HOXD1Q9GZZ0 328 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 OR52D1Q9H346 318 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 UBQLN3Q9H347 655 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 MED20Q9H944 212 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 WDR54Q9H977 334 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 MCCC2Q9HCC0 563 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 HHATLQ9HCP6 504 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 NCDNQ9UBB6 729 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 CLEC2DQ9UHP7 191 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ICAM5Q9UMF0 924 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.57□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 A0A087WUJ7 227 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 FAM183AA6NL82 134 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PRR33A8MZF0 331 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 H3BMQ9 156 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 BHLHE40O14503 412 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SOCS6O14544 535 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SURF4O15260 269 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PTP4A3O75365 173 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ZFAND5O76080 213 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PPP1R3DO95685 299 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 NUDT14O95848 222 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PTHP01270 115 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SAGP10523 405 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 DBTP11182 482 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 TCN2P20062 427 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 F8A1P23610 371 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PSMB9P28065 219 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 OTX2P32243 289 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 EVI2BP34910 448 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SOX3P41225 446 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 FOLR3P41439 243 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SLC15A1P46059 708 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ID4P47928 161 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SMSP52788 366 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PNLIPRP2P54317 469 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 GAS1P54826 345 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 COPZ1P61923 177 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 E2F1Q01094 437 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 TEKQ02763 1124 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF91Q05481 1191 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 IRF3Q14653 427 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 CSRP2Q16527 193 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SLC27A4Q6P1M0 643 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 BORAQ6PGQ7 559 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 MRGPREQ86SM8 312 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 PIP4P1Q86T03 277 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 ZNF440Q8IYI8 595 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 CDK20Q8IZL9 346 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 GHDCQ8N2G8 530 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 STX19Q8N4C7 294 aa5.56□□□□□ -1.52
SKAP2-204ENST00000481204 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms