RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475158.1

CDH23-211, Transcript of cadherin related 23, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CDH23, Length 4,114 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-211ENST00000475158 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 COPS3Q9UNS2 423 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ACACAQ13085 2346 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 A0A0G2JNG1 304 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 A0A1B0GV50 99 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 MAN2B1O00754 1011 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 AKR1C4P17516 323 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 NUDT1P36639 197 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 EMP2P54851 167 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 TSPAN31Q12999 210 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CCINQ13939 588 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 KIR2DS5Q14953 304 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 BCL2A1Q16548 175 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 DUSP6Q16828 381 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 FGF14Q92915 247 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 MYADMQ96S97 322 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 TP53I11O14683 189 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SLC16A6O15403 523 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 LAMTOR5O43504 91 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 KCNK2O95069 426 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 AMY2AP04746 511 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 GIFP27352 417 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 TEAD1P28347 426 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SLC1A3P43003 542 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ART1P52961 327 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SLC35A2P78381 396 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CHRDL2Q6WN34 429 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SYT9Q86SS6 491 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SLC6A18Q96N87 628 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ACER3Q9NUN7 267 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 A0A087WUU8 490 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 GABRPO00591 440 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 KCNJ13O60928 360 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 GLAP06280 429 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ZNF43P17038 809 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CD22P20273 847 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CD6P30203 668 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 PER3P56645 1201 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 TNFRSF17Q02223 184 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 KCNAB1Q14722 419 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 TMEM215Q68D42 235 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 LYSMD1Q96S90 227 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 MBOAT4Q96T53 435 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ASB6Q9NWX5 421 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CBLCQ9ULV8 474 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 MED16Q9Y2X0 877 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.95□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 RREB1Q92766 1687 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 A0A1B0GWA3 101 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SLC2A10O95528 541 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SLC2A5P22732 501 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CASRP41180 1078 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ADPRHP54922 357 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CTBP2P56545 445 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 REEP5Q00765 189 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 FCN2Q15485 313 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 Q6ZNB5 142 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 PTOV1Q86YD1 416 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ZNF611Q8N823 705 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 FBXW5Q969U6 566 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 OR51J1Q9H342 316 aa8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CDH23-211ENST00000475158 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms