RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473191.1

USP40-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 3

Gene USP40, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-212ENST00000473191 DDIT4LQ96D03 193 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 ITCHQ96J02 903 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 BDH2Q9BUT1 245 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 EMC3Q9P0I2 261 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.67□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 MAGEA8P43361 318 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 HTR3AP46098 478 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 CLK1P49759 484 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 IDH3AP50213 366 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 ZNF83P51522 516 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 P2RY4P51582 365 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 LGALS3BPQ08380 585 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 SLC17A1Q14916 467 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 RGNQ15493 299 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 OR7A5Q15622 319 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 GABRA6Q16445 453 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 LIN52Q52LA3 116 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 TTMPQ5BVD1 217 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 B3GLCTQ6Y288 498 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 WDR31Q8NA23 367 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 NGBQ9NPG2 151 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 ASB6Q9NWX5 421 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 MALT1Q9UDY8 824 aa14.66□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 CIB4A0PJX0 185 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 FAM234BA2RU67 622 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 LIPT2A6NK58 231 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 DNPH1O43598 174 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 ERLIN1O75477 346 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 IGHV4-39P01824 125 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 PCSK6P29122 969 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 CRISP3P54108 245 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 SLC35A1P78382 337 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 KRTAP1-1Q07627 177 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 RMND5AQ9H871 391 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 SEC14L4Q9UDX3 406 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 CADP27708 2225 aa14.65□□□□□ -0.06
USP40-212ENST00000473191 A0A1W2PP18 115 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 E7EQL1 145 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 CLIC1O00299 241 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 THBS1P07996 1170 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 CXCR1P25024 350 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 IDUAP35475 653 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 ACVR1BP36896 505 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 CDH11P55287 796 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 GNA13Q14344 377 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 RNF220Q5VTB9 566 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 HTRA1Q92743 480 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 C3orf49Q96BT1 292 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 MUCL1Q96DR8 90 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 C7orf26Q96N11 449 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 MUS81Q96NY9 551 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 PRR14Q9BWN1 585 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 CCDC167Q9P0B6 97 aa14.64□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 INAFM1C9JVW0 142 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 RNF223E7ERA6 249 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 M0R1B8 84 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 GPR171O14626 319 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 EGR4Q05215 589 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 LINGO2Q7L985 606 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 GPAT4Q86UL3 456 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 KDM8Q8N371 416 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 PMM1Q92871 262 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 SPATA9Q9BWV2 254 aa14.63□□□□□ -0.07
USP40-212ENST00000473191 CALML5Q9NZT1 146 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms