RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	SKP1	P63208	163 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	BTG2	P78543	158 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	FUT7	Q11130	342 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	TNK1	Q13470	666 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	ISX	Q2M1V0	245 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	BCORP1	Q8N888	145 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	CACNG2	Q9Y698	323 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		15.52	■□□□□ 0.08
TOM1-210	ENST00000449058	ARL6IP5	O75915	188 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	EPX	P11678	715 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LGALS3BP	Q08380	585 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CCIN	Q13939	588 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ERV3-1	Q14264	604 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PON3	Q15166	354 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NNAT	Q16517	81 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SLC36A2	Q495M3	483 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	C6orf183	Q5T699	404 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	15.51	■□□□□ 0.07	2e-6	■■■■□ 22.8
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OR7A10	O76100	309 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RAB30	Q15771	203 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	C3orf49	Q96BT1	292 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TOE1	Q96GM8	510 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OR10A5	Q9H207	317 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NCDN	Q9UBB6	729 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		15.51	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SHISA7	A6NL88	538 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058		B4DGG1	531 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CLDN4	O14493	209 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	FLRT2	O43155	660 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SPI1	P17947	270 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC58	Q4VC31	144 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SNX33	Q8WV41	574 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	NMNAT3	Q96T66	252 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GON7	Q9BXV9	100 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	COPS3	Q9UNS2	423 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OR6C68	A6NDL8	312 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OR2W5	A6NFC9	320 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF749	O43361	778 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	UBL3	O95164	117 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RAB25	P57735	213 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MAB21L1	Q13394	359 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	KLHL26	Q53HC5	615 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	SYT9	Q86SS6	491 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	PLCZ1	Q86YW0	608 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	HSD17B8	Q92506	261 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	YIPF5	Q969M3	257 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	LRRC61	Q9BV99	259 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	GNG8	Q9UK08	70 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	EML5	Q05BV3	1969 aa		15.5	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PPK0	400 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	IMPA2	O14732	288 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	CLPS	P04118	112 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	MAOA	P21397	527 aa		15.49	■□□□□ 0.07
TOM1-210	ENST00000449058	EVI2B	P34910	448 aa		15.49	■□□□□ 0.07

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