RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 SIRPAP78324 504 aa14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CEP78Q5JTW2 689 aa14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 Q6ZS52 159 aa14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PPC4 97 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 FZD7O75084 574 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SERPINA3P01011 423 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 AHCYP23526 432 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PGDP52209 483 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PLA1AQ53H76 456 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZPLD1Q8TCW7 415 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 TCTN2Q96GX1 697 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NMNAT3Q96T66 252 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 COPS3Q9UNS2 423 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1W2PPK0 400 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF749O43361 778 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PPM1BO75688 479 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PON3Q15166 354 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GXYLT1Q4G148 440 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 KLHL26Q53HC5 615 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SYT9Q86SS6 491 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR6C68A6NDL8 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SCO2O43819 266 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR7A10O76100 309 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CD1AP06126 327 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ATF1P18846 271 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 BTCP35070 178 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 EFR3AQ14156 821 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ISXQ2M1V0 245 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 YIF1BQ5BJH7 314 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LMF1Q96S06 567 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MFRPQ9BY79 579 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ABCG5Q9H222 651 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NOTOA8MTQ0 251 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 C2CD4DB7Z1M9 353 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 UCHL1P09936 223 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 EPXP11678 715 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SPI1P17947 270 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CAPZBP47756 277 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 FASLGP48023 281 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 HSD17B7P56937 341 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 FAM71CQ8NEG0 241 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SELENOFO60613 162 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 LGALS3BPQ08380 585 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SLC36A2Q495M3 483 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GHDCQ8N2G8 530 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 OR4D9Q8NGE8 314 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SNX33Q8WV41 574 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 NCDNQ9UBB6 729 aa14.65□□□□□ -0.06
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM131Q92545 1883 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GZMKP49863 264 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 BTG1P62324 171 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 FAPQ12884 760 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 RASD2Q96D21 266 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 MCUBQ9NWR8 336 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 C2orf42Q9NWW7 574 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 CACNG2Q9Y698 323 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0B4J203 849 aa14.64□□□□□ -0.07
SHQ1-202ENST00000444040 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms