RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439512.5

TOM1-207, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 3

Gene TOM1, Length 800 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-207ENST00000439512 DACH2Q96NX9 599 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.67□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 LIPT2A6NK58 231 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 A6NNC1 897 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ZNF724A8MTY0 619 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 M0R3H8 397 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TPST2O60704 377 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 RAMP1O60894 148 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 CTAG2O75638 210 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 GPIP06744 558 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 NCALDP61601 193 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 H3F3AP84243 136 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 PDK3Q15120 406 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 OR1Q1Q15612 314 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 C1orf140Q5VVS0 124 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ULK3Q6PHR2 472 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 CCDC80Q76M96 950 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 PIGXQ8TBF5 258 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TAMM41Q96BW9 452 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 MCHR1Q99705 422 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 EVA1AQ9H8M9 152 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 FANCFQ9NPI8 374 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 CMTM6Q9NX76 183 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 SELENONQ9NZV5 590 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 EMC3Q9P0I2 261 aa14.66□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TACC2O95359 2948 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 AKAP9Q99996 3911 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 FAM221AA4D161 298 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ZNF716A6NP11 495 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 AKR7A3O95154 331 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 C8BP07358 591 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 VEZF1Q14119 521 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ALG10BQ5I7T1 473 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TMEM99Q8N816 258 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 OR2T12Q8NG77 320 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 STK35Q8TDR2 534 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ARHGDIGQ99819 225 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 MED18Q9BUE0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 RASSF1Q9NS23 344 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1-207ENST00000439512 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 GPR171O14626 319 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NPIPB7O75200 414 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 AHSA1O95433 338 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PNMTP11086 282 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CD247P20963 164 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 EDNRAP25101 427 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CCKARP32238 428 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 RPS5P46782 204 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 OR3A2P47893 321 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NUDT2P50583 147 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CRYBA2P53672 197 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 EGR4Q05215 589 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NRF1Q16656 503 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 P3H2Q8IVL5 708 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 MICU2Q8IYU8 434 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 C12orf10Q9HB07 376 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 PRSS50Q9UI38 385 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 AP3M1Q9Y2T2 418 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1-207ENST00000439512 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms