RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF575Q86XF7 245 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 PROKR2Q8NFJ6 384 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 OR5T3Q8NGG3 340 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 ASZ1Q8WWH4 475 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 KIFAP3Q92845 792 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 C11orf52Q96A22 123 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 FAF2Q96CS3 445 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF670Q9BS34 389 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 NUDT15Q9NV35 164 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 ELOVL2Q9NXB9 296 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD50Q92878 1312 aa3.91□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 MYOM1P52179 1685 aa3.9□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 USP47Q96K76 1375 aa3.9□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.9□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 NUP188Q5SRE5 1749 aa3.9□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 CCT8L1PA6NM43 557 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 F8VZ95 297 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 H0YHG0 523 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 FCN1O00602 326 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 MAGEC1O60732 1142 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 MYL2P10916 166 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 HSD17B1P14061 328 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SELEP16581 610 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 CD38P28907 300 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 CD80P33681 288 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 OPRD1P41143 372 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ETV5P41161 510 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 CLDN18P56856 261 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K7CLP57077 242 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC8A3P57103 927 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SLAQ13239 276 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 UPP1Q16831 310 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ISXQ2M1V0 245 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM16LQ309B1 348 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ACER2Q5QJU3 275 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 H3F3CQ6NXT2 135 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2L13Q8N349 312 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 MTURNQ8N3F0 131 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 CATSPER1Q8NEC5 780 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 OR52B6Q8NGF0 335 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 OR52H1Q8NGJ2 320 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF596Q8TC21 504 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC20Q8TCA0 184 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 TOMM40LQ969M1 308 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ASB9Q96DX5 294 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB3CQ96E17 227 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF479Q96JC4 524 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SP140LQ9H930 580 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 TREM1Q9NP99 234 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 DEPPQ9NTK1 212 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP57Q9NU63 452 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 QPCTLQ9NXS2 382 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 CHMP5Q9NZZ3 219 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 CLN8Q9UBY8 286 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 USP16Q9Y5T5 823 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa3.9□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 CLIP1P30622 1438 aa3.89□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa3.89□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A087WW49 117 aa3.89□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 TRDCB7Z8K6 153 aa3.89□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 SLCO1B7G3V0H7 640 aa3.89□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 AIM2O14862 343 aa3.89□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 OR10H3O60404 316 aa3.89□□□□□ -1.79
CBX1P4-201ENST00000439415 HUS1O60921 280 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms