RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 CCKARP32238 428 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 NCALDP61601 193 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 ELOA3BQ3SY89 546 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 TFAP2EQ6VUC0 442 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 ELOA3Q8NG57 546 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR32P1Q8NGA4 272 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 PIGXQ8TBF5 258 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 TAMM41Q96BW9 452 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 MED18Q9BUE0 208 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 PDZD2O15018 2839 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-202ENST00000425695 LIPT2A6NK58 231 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF724A8MTY0 619 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 DNPH1O43598 174 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 GPIP06744 558 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 EDNRAP25101 427 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 PCYT1AP49585 367 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 C1orf140Q5VVS0 124 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 STAC2Q6ZMT1 411 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 LSMEM1Q8N8F7 131 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 RASSF1Q9NS23 344 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TESMINQ9Y4I5 508 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SPG11Q96JI7 2443 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF716A6NP11 495 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TPST2O60704 377 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 AKR7A3O95154 331 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 LGI1O95970 557 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 H3F3AP84243 136 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 POU4F3Q15319 338 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 OR1Q1Q15612 314 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ALG10BQ5I7T1 473 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF100Q8IYN0 542 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM99Q8N816 258 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NRGNQ92686 78 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ARHGDIGQ99819 225 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TAPBPLQ9BX59 468 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 MYLK2Q9H1R3 596 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 FANCFQ9NPI8 374 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 EMC3Q9P0I2 261 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 PRSS50Q9UI38 385 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCA4P78363 2273 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM221AA4D161 298 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CD247P20963 164 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 OR3A2P47893 321 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 PDK3Q15120 406 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 TSC22D1Q15714 1073 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC80Q76M96 950 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 P3H2Q8IVL5 708 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 STK35Q8TDR2 534 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC25A36Q96CQ1 311 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 MCHR1Q99705 422 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CMTM6Q9NX76 183 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SELENONQ9NZV5 590 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NPIPB7O75200 414 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 AHSA1O95433 338 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ADAP00813 363 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 RPS5P46782 204 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CRYBA2P53672 197 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 EGR4Q05215 589 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NRF1Q16656 503 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ERICH5Q6P6B1 374 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 ULK3Q6PHR2 472 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 PAQR6Q6TCH4 344 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 GABRG1Q8N1C3 465 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4D11Q8NGI4 311 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 OR6T1Q8NGN1 323 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC47A1Q96FL8 570 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 AKAP6Q13023 2319 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 C8BP07358 591 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 PNMTP11086 282 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 NTF4P34130 210 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 CDC20BQ86Y33 519 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 OR2T12Q8NG77 320 aa22.16■■□□□ 1.14
HTATSF1-202ENST00000425695 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.16■■□□□ 1.14
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