RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384139.1

RNU6-187P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 187, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-187P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-187P-201ENST00000384139 TIMM29Q9BSF4 260 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 ANGPTL4Q9BY76 406 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 RACGAP1Q9H0H5 632 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAB17Q9H0T7 212 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 DUSP21Q9H596 190 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SRD5A3Q9H8P0 318 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 LMAN1LQ9HAT1 526 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHPKQ9UHJ6 478 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYTH4Q9UIA0 394 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLA2G4CQ9UP65 541 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CBY1Q9Y3M2 126 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 IKBKGQ9Y6K9 419 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 LTBP1Q14766 1721 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-187P-201ENST00000384139 PLXNB1O43157 2135 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LTBP4Q8N2S1 1624 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 A0A1B0GVL5 298 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TTC26A0AVF1 554 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 C5orf51A6NDU8 294 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 C5orf52A6NGY3 159 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 A6NIZ1 184 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 WASHC1A8K0Z3 465 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 BTNL10A8MVZ5 291 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 C4orf51C9J302 202 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 F5H6K3 240 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 H0Y626 953 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 LY6LH3BQJ8 138 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DYNC1I1O14576 645 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 BPY2O14599 106 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CASKO14936 926 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TM9SF1O15321 606 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NVLO15381 856 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 AQP9O43315 295 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MBTPS2O43462 519 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 HCRTO43612 131 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 STX6O43752 255 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NME2P1O60361 137 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 DOK2O60496 412 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 UGT1A9O60656 530 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSF2BPO75031 334 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CCNKO75909 580 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 REC8O95072 547 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 S1PR2O95136 353 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 GABARAPO95166 117 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SCELO95171 688 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SYNGR4O95473 234 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 HSPA4LO95757 839 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 AGR2O95994 175 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NDUFB10O96000 172 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MOSP00540 346 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 JCHAINP01591 159 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 APCSP02743 223 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ALPPP05187 535 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PFN1P07737 140 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CSF3P09919 207 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CALM1P0DP23 149 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CALM2P0DP24 149 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CALM3P0DP25 149 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NR2F1P10589 423 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 UQCRBP14927 111 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 AKR1B1P15121 316 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 ATP6V1B2P21281 511 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 HLA-DMAP28067 261 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 PSMB4P28070 264 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CALCRP30988 508 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SHMT2P34897 504 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 OR1D2P34982 312 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 COPB2P35606 906 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SSR1P43307 286 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 MAGEA6P43360 314 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 YAP1P46937 504 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 NPY2RP49146 381 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SLC11A1P49279 550 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 STARP49675 285 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SNU13P55769 128 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 SRP54P61011 504 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-187P-201ENST00000384139 RAP1BP61224 184 aa0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms