RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PI4KAP42356 2102 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM221BA6H8Z2 402 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 NOTOA8MTQ0 251 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 PAHP00439 452 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ACVR1BP36896 505 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 PITPNBP48739 271 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTC1P68032 377 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTA1P68133 377 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 GPLD1P80108 840 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 SSX6Q7RTT6 188 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 LSMEM1Q8N8F7 131 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 TEX19Q8NA77 164 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5J2Q8NH18 312 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 SERTAD3Q9UJW9 196 aa17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 AKR7A2O43488 359 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV1D-16P01601 117 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CD27P26842 260 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A6P31641 620 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CAPZA2P47755 286 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 NRG3P56975 720 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB38P57729 211 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 BTG2P78543 158 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC58Q4VC31 144 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00114Q6XXX2 140 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC43A2Q8N370 569 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF614Q8N883 585 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM2Q9C040 744 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PR77 199 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 SOX30O94993 753 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 GUSBP08236 651 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 EVI2BP34910 448 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 HTR2BP41595 481 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 POU4F2Q12837 409 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ACSM3Q53FZ2 586 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 GHSRQ92847 366 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 RFT1Q96AA3 541 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR27Q9NS67 375 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 THADAQ6YHU6 1953 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFRSF10AO00220 468 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF217O75362 1048 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2B3O76000 313 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 BLKP51451 505 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf57Q0VDD7 668 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ALG10BQ5I7T1 473 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 BICRALQ6AI39 1079 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CREB3L2Q70SY1 520 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A15Q8N5U1 240 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 DTX3Q8N9I9 347 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4N2Q8NGD1 307 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CLIP3Q96DZ5 547 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 POMT2Q9UKY4 750 aa17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 IFNGP01579 166 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 PYCR1P32322 319 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 BTBD16Q32M84 506 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR135Q8IZ08 494 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 SNAPC3Q92966 411 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ABHD1Q96SE0 405 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRNA9Q9UGM1 479 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GVC2 190 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 A6NIN4 97 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 TGFBR3LH3BV60 316 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10H2O60403 315 aa17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
SH3BP1-201ENST00000357436 ASPMQ8IZT6 3477 aa17.21■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SMLR1H3BR10 107 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 NME1P15531 152 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 MAOAP21397 527 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 AHCYP23526 432 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ASB18Q6ZVZ8 466 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS58Q8IYP2 241 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNA1EQ15878 2313 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GVT2 93 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OGG1O15527 345 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 TFP02787 698 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 PROS1P07225 676 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1D5P58170 312 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 LYPD8Q6UX82 237 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52E2Q8NGJ4 325 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR13C5Q8NGS8 318 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 HYLS1Q96M11 299 aa17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCG5Q9H222 651 aa17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms