RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356162.5

CNOT4-202, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CNOT4, Length 2,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-202ENST00000356162 ZNF524Q96C55 264 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 NSL1Q96IY1 281 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 MUC13Q9H3R2 512 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PIGMQ9H3S5 423 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM185BQ9H7F4 350 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 GP6Q9HCN6 339 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 GLRX2Q9NS18 164 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 RLIMQ9NVW2 624 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ALKBH4Q9NXW9 302 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 SELENONQ9NZV5 590 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 OSGIN1Q9UJX0 560 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 USP22Q9UPT9 525 aa3.56□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 A0A0B4J2E0 115 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 A0A1B0GWA3 101 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 A0A1B0GX12 115 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 A0A1W2PNV4 684 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 FAM90A27PA6NNH2 459 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 M0QX08 132 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 M0R3H8 397 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TPST1O60507 370 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TOXO94900 526 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 FESP07332 822 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TFPIP10646 304 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PNMTP11086 282 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PRG2P13727 222 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 GGT1P19440 569 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CXCR1P25024 350 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 KDELR2P33947 212 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 IDUAP35475 653 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CRYBA2P53672 197 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 RAC3P60763 192 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 BNIP2Q12982 314 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PDK3Q15120 406 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PON3Q15166 354 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 POU4F3Q15319 338 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 NPTX1Q15818 432 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 SGCBQ16585 318 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 FXNQ16595 210 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CDPF1Q6NVV7 123 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ZNF613Q6PF04 617 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TMPPEQ6ZT21 453 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CARM1Q86X55 608 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ADGRG3Q86Y34 549 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ARHGAP24Q8N264 748 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 SLC43A2Q8N370 569 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 SMYD1Q8NB12 490 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 NAXEQ8NCW5 288 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 OR6S1Q8NH40 331 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 LILRB4Q8NHJ6 448 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PIGXQ8TBF5 258 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 RNF128Q8TEB7 428 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 LZICQ8WZA0 190 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 SLC38A4Q969I6 547 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 SLC47A1Q96FL8 570 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 LRRC46Q96FV0 321 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 OR5B2Q96R09 309 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 RNF122Q9H9V4 155 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TMEM27Q9HBJ8 222 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ADA2Q9NZK5 511 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 KALRNO60229 2985 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 A8MVM7 634 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PRSS44E7EML9 344 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 H0YC42 278 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CHP2O43745 196 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CYTIPO60759 359 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 NPIPB7O75200 414 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 GMNNO75496 209 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 OR5F1O95221 314 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 AHSA1O95433 338 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 CLDN1O95832 211 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TGM6O95932 706 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 ENPP1P22413 925 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PEX19P40855 299 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 PCYT1AP49585 367 aa3.55□□□□□ -1.84
CNOT4-202ENST00000356162 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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