RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 MAXP61244 160 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HTD2P86397 168 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZP2Q05996 745 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SLC22A24Q8N4F4 322 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 FRMD1Q8N878 549 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 L3MBTL4Q8NA19 623 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NUP43Q8NFH3 380 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PLEKHA3Q9HB20 300 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PARPBPQ9NWS1 579 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 NSG2Q9Y328 171 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PPE2 198 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PR64 198 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PRV1 198 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LRATO95237 230 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 TGFBR3Q03167 851 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 HAGHQ16775 308 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 SSX9Q7RTT3 188 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 PPP1R3BQ86XI6 285 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 OR52P1PQ8NH57 321 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 TPOP07202 933 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 DOC2BQ14184 412 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 TEX30Q5JUR7 227 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 VRK2Q86Y07 508 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 DUSP1P28562 367 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
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PTPRD-201ENST00000355233 PGGHGQ32M88 737 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRD-201ENST00000355233 Q499Y3 187 aa4.59□□□□□ -1.67
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