RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRA5P31644 462 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFSF8P32971 234 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GRK5P34947 590 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MC3RP41968 323 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYBB2P43320 205 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MAN2A2P49641 1150 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH11P55287 796 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB8AP61006 207 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 IFITM3Q01628 133 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BDH1Q02338 343 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNEQ04844 493 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSM1Q08AH1 577 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HYAL2Q12891 473 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP8Q13202 625 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GPR50Q13585 617 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFA5Q16718 116 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PGGHGQ32M88 737 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 VWA2Q5GFL6 755 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SYT9Q86SS6 491 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OOSP2Q86WS3 158 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB43Q86YS6 212 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PHC2Q8IXK0 858 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF619Q8N2I2 560 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAIQ8N9R8 606 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 AVL9Q8NBF6 648 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52N1Q8NH53 320 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HTRA1Q92743 480 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TP53INP1Q96A56 240 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 STACQ99469 402 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF559Q9BR84 538 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 JAM3Q9BX67 310 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC22A4Q9H015 551 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FN3KQ9H479 309 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE7BQ9NP56 450 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 EQTNQ9NQ60 294 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB6Q9NWX5 421 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RARRES3Q9UL19 164 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.45□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GUH1 482 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 UNC119BA6NIH7 251 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C2orf74A8MZ97 194 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC19A2O60779 497 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP6V1G1O75348 118 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNGP01579 166 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GUSBP08236 651 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf89P0DMQ9 161 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CD99P14209 185 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CPMP14384 443 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CD53P19397 219 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ALAS2P22557 587 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SSTR2P30874 369 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR1FP30939 366 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 OTX2P32243 289 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TGFBR1P36897 503 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS19P39019 145 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX3P41225 446 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 CAPZBP47756 277 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 AVPR1BP47901 424 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 INPP1P49441 399 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ETV1P50549 477 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 ART1P52961 327 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 RRADP55042 308 aa6.44□□□□□ -1.38
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R43P59537 309 aa6.44□□□□□ -1.38
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