RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 GOSR2O14653 212 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 C7P10643 843 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 P2RX1P51575 399 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 MEF2DQ14814 521 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.83□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 GFRALQ6UXV0 394 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.83□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.83□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa9.83□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 SERINC4A6NH21 518 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 FANCGO15287 622 aa9.82□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 MMP12P39900 470 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 WNT4P56705 351 aa9.82□□□□□ -0.84
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TRPS1-201ENST00000220888 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 AKAIN1P0CW23 69 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 EMP3P54852 163 aa9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
TRPS1-201ENST00000220888 MOGSQ13724 837 aa9.82□□□□□ -0.84
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