RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 TIGARQ9NQ88 270 aa7.56□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 FGF21Q9NSA1 209 aa7.56□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.56□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PQ09 198 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 OR6C76A6NM76 312 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 HCRTR2O43614 444 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SLC19A2O60779 497 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NCR1O76036 304 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 DCNP07585 359 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 PYCR1P32322 319 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 CFHR1Q03591 330 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 INSL4Q14641 139 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF74Q16587 644 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 GXYLT1Q4G148 440 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 VWA2Q5GFL6 755 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 CNIH2Q6PI25 160 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SYS1Q8N2H4 156 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SLC25A45Q8N413 288 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SNX33Q8WV41 574 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ADIPOR1Q96A54 375 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NMNAT3Q96T66 252 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ATF6BQ99941 703 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NUDT9Q9BW91 350 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 LAT2Q9GZY6 243 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SLC22A4Q9H015 551 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NRIP3Q9NQ35 241 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 MUTYHQ9UIF7 546 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 TBC1D24Q9ULP9 559 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PPC1 479 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 FAM25AB3EWG3 89 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 FAM25CB3EWG5 89 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 FAM25GB3EWG6 89 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 K7ESF4 209 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NDUFB5O43674 189 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 HPGDSO60760 199 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SLC25A12O75746 678 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NUDT14O95848 222 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2ABP04908 130 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SPNP16150 400 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SPI1P17947 270 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ITPKBP27987 946 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 TALDO1P37837 337 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 TPTEP56180 551 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NRG3P56975 720 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 OR12D2P58182 307 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ERVK-25P63136 954 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 HSF2Q03933 536 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 IL10RAQ13651 578 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 IL18Q14116 193 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 TAB1Q15750 504 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 BAK1Q16611 211 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ALG10Q5BKT4 473 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 IDNKQ5T6J7 187 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 HBMQ6B0K9 141 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 LEG1Q6P5S2 330 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 CBLN3Q6UW01 205 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 C9orf40Q8IXQ3 194 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 C19orf18Q8NEA5 215 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 OR51L1Q8NGJ5 315 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2ACQ93077 130 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 RASD2Q96D21 266 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 IER2Q9BTL4 223 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 MMP25Q9NPA2 562 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.55□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 EML5Q05BV3 1969 aa7.54□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PQD3 144 aa7.54□□□□□ -1.2
VAMP3-201ENST00000054666 CDC14CA4D256 554 aa7.54□□□□□ -1.2
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