RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 NRF1Q16656 503 aa21.75■■□□□ 1.07
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CAPNS1-216ENST00000628306 STK32CQ86UX6 486 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF18BQ86Y91 864 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PEX5LQ8IYB4 626 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PM20D2Q8IYS1 436 aa21.75■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF619Q8N2I2 560 aa21.75■■□□□ 1.07
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CAPNS1-216ENST00000628306 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-216ENST00000628306 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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CAPNS1-216ENST00000628306 HEXAP06865 529 aa21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-216ENST00000628306 CT45A2Q5DJT8 189 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 DESI1Q6ICB0 168 aa21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa21.72■■□□□ 1.07
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CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ACER3Q9NUN7 267 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 VNN3Q9NY84 501 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC13A4Q9UKG4 626 aa21.72■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID1AO14497 2285 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 TNFRSF11BO00300 401 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 TP53I11O14683 189 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 NME6O75414 186 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 RRM2P31350 389 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGDSP41222 190 aa21.71■■□□□ 1.07
CAPNS1-216ENST00000628306 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
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