RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	BMX	P51813	675 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	REEP5	Q00765	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF45	Q02386	682 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	STK38	Q15208	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CPTP	Q5TA50	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2L5	Q8NG80	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZFP90	Q8TF47	636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	EME1	Q96AY2	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CLN8	Q9UBY8	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	C7orf72	A4D263	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LRIT2	A6NDA9	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	C22orf46	C9J442	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MANBA	O00462	879 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	NR5A2	O00482	541 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	T	O15178	435 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN2	O60636	221 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LIPF	P07098	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CT62	P0C5K7	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CBR1	P16152	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	NPPB	P16860	134 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RBL1	P28749	1068 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PITPNB	P48739	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPA	P49450	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SELENOP	P49908	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	RAC3	P60763	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TNP2	Q05952	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	NAE1	Q13564	534 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CSHL1	Q14406	222 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TANK	Q92844	425 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	AGRN	O00468	2067 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PRD5	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PRF3	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1W2PRM7	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BSH0	61 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL24	O00175	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR171	O14626	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	NPFF	O15130	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	TM9SF1	O15321	606 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB14	O43829	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CLPTM1	O96005	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	CHRNB2	P17787	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNAP23-223	ENST00000627440	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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