RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 HEATR5AQ86XA9 2040 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0G2JPF8 293 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DPPA5A6NC42 116 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PDLIM1O00151 329 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJA2O60884 412 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RAF1P04049 648 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TFPTP0C1Z6 253 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GKN3PP0CG01 181 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 T-ENOLP0DO92 83 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NID1P14543 1247 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PPP3CBP16298 524 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CRYGSP22914 178 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 IL32P24001 234 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TACR3P29371 465 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SQLEQ14534 574 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RGNQ15493 299 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TESK1Q15569 626 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF440Q8IYI8 595 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CADM2Q8N3J6 435 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DDIT4LQ96D03 193 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM19Q96HH6 336 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TSC22D3Q99576 134 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 OR11A1Q9GZK7 315 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GP6Q9HCN6 339 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NPHS2Q9NP85 383 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ABCA4P78363 2273 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 A0A096LPI6 279 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 A0A0G2JND7 137 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 EVPLLA8MZ36 301 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CYTIPO60759 359 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ADAP00813 363 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 KLK2P20151 261 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CXCR1P25024 350 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CCKARP32238 428 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 SLC1A3P43003 542 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ATP4BP51164 291 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MVDP53602 400 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS12P56730 875 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 EPS8Q12929 822 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FADDQ13158 208 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TSC22D1Q15714 1073 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PAGE3Q5JUK9 113 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF836Q6ZNA1 936 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT5Q7Z7M9 940 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FUNDC1Q8IVP5 155 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MAL2Q969L2 176 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ARL5BQ96KC2 179 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FAM210AQ96ND0 272 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 FOXC2Q99958 501 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PSD2Q9BQI7 771 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 MYLK2Q9H1R3 596 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms