RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZFP90	Q8TF47	636 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PROX1	Q92786	737 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MAL2	Q969L2	176 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RCN3	Q96D15	328 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RNF145	Q96MT1	663 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MED17	Q9NVC6	651 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	VAPA	Q9P0L0	249 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MKLN1	Q9UL63	735 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	USP22	Q9UPT9	525 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	USF3	Q68DE3	2245 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ATR	Q13535	2644 aa		6.07	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688		A0A096LNT2	108 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688		A0A096LPI6	279 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PQD3	144 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CLDN24	A6NM45	220 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SHISA9	B4DS77	424 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CLIC1	O00299	241 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	HMGN4	O00479	90 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SCD	O00767	359 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MRAS	O14807	208 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	AIM2	O14862	343 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	OIP5	O43482	229 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	LMX1B	O60663	402 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FCMR	O60667	390 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NDUFS7	O75251	213 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CYP7B1	O75881	506 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PGM3	O95394	542 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	BCHE	P06276	602 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	SRD5A1	P18405	259 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ATP6V1C1	P21283	382 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PTAFR	P25105	342 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	AQP1	P29972	269 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TTK	P33981	857 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MAP3K8	P41279	467 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	OR3A2	P47893	321 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CDH11	P55287	796 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RAC3	P60763	192 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PPA1	Q15181	289 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CD226	Q15762	336 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	BHLHA15	Q7RTS1	189 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NATD1	Q8N6N6	113 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FAM110B	Q8TC76	370 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ABHD3	Q8WU67	409 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	FAM168A	Q92567	244 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NEUROG1	Q92886	237 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MOAP1	Q96BY2	351 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ROPN1L	Q96C74	230 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NEURL3	Q96EH8	262 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	BTBD2	Q9BX70	525 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	PIGU	Q9H490	435 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	BCO1	Q9HAY6	547 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	NTM	Q9P121	344 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	STAB1	Q9NY15	2570 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF724	A8MTY0	619 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688		H3BNH8	94 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688		H7C417	338 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	ABCD4	O14678	606 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	CCDC22	O60826	627 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	RAMP1	O60894	148 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	H6PD	O95479	791 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	KRT75	O95678	551 aa		6.05	□□□□□ -1.44
CS-233	ENST00000552688	OPN1LW	P04000	364 aa		6.05	□□□□□ -1.44

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