RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 C18orf63Q68DL7 685 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 APOOLQ6UXV4 268 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RPTNQ6XPR3 784 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 WDR88Q6ZMY6 472 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TMUB2Q71RG4 321 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PDZD9Q8IXQ8 264 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PFN4Q8NHR9 129 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CDS1Q92903 461 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CXorf58Q96LI9 332 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SEC22CQ9BRL7 303 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ENKD1Q9H0I2 346 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RNF186Q9NXI6 227 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZNF69Q9UC07 566 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 AK1P00568 194 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ICAM2P13598 275 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RAB3AP20336 220 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CERS1P27544 350 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 NOS3P29474 1203 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PTGER1P34995 402 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RBM34P42696 430 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PTH2RP49190 550 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PPP2CBP62714 309 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PPP2CAP67775 309 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LGALS3BPQ08380 585 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TMEM255AQ5JRV8 349 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR5M10Q6IEU7 315 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SSX6Q7RTT6 188 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CDH26Q8IXH8 852 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SLC35F2Q8IXU6 374 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR2L13Q8N349 312 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RIT1Q92963 219 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 HAVCR1Q96D42 359 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PEX11GQ96HA9 241 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 C10orf90Q96M02 699 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SDF2Q99470 211 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZNF559Q9BR84 538 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ZBP1Q9H171 429 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 IFT46Q9NQC8 304 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CA10Q9NS85 328 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LTBP2Q14767 1821 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MYO10Q9HD67 2058 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 D6RAR5 112 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PPP1R3DO95685 299 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LPLP06858 475 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LAMP2P13473 410 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SRMP19623 302 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 EDNRAP25101 427 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CCR2P41597 374 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 P2RX1P51575 399 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 GMFBP60983 142 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LTB4RQ15722 352 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 LINC00303Q3SY05 128 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 TP53I3Q53FA7 332 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 GSG1LQ6UXU4 331 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 CFAP77Q6ZQR2 320 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 PM20D2Q8IYS1 436 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 IZUMO1Q8IYV9 350 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR7G2Q8NG99 324 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 RAB7BQ96AH8 199 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 MIB2Q96AX9 1013 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ORAI1Q96D31 301 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 SCLYQ96I15 445 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 OR14A2Q96R54 314 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-202ENST00000542324 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms