RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 KLF10Q13118 480 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 TESK1Q15569 626 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 REEP3Q6NUK4 255 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF440Q8IYI8 595 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 SLC43A2Q8N370 569 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 C3orf49Q96BT1 292 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PIK3IP1Q96FE7 263 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PIF1Q9H611 641 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 SAR1AQ9NR31 198 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 KLHL9Q9P2J3 617 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 NDRG3Q9UGV2 375 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 USP22Q9UPT9 525 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa16.64■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 FXYD1O00168 92 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ADAP00813 363 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ETS2P15036 469 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PTNP21246 168 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 FPR1P21462 350 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CRYGSP22914 178 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 HTR3AP46098 478 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 DMTNQ08495 405 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 HSP90B2PQ58FF3 399 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ALKBH2Q6NS38 261 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 C10orf82Q8WW14 230 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ACTR6Q9GZN1 396 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC134Q9H6E4 229 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ARMCX1Q9P291 453 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM181Q9P2C4 612 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 IFT52Q9Y366 437 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa16.63■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 EVPLLA8MZ36 301 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM229AB2RXF0 380 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CASKO14936 926 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF208O43345 1280 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 OR3A2P47893 321 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PCYT1AP49585 367 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CEACAM7Q14002 265 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 OR7A5Q15622 319 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CYP51A1Q16850 503 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 RABL3Q5HYI8 236 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 METTL21CQ5VZV1 264 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 REP15Q6BDI9 236 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 BEND4Q6ZU67 534 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 SNX32Q86XE0 403 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 WFDC8Q8IUA0 241 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 P3H2Q8IVL5 708 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 SMYD1Q8NB12 490 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 S100PBPQ96BU1 408 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 DDIT4LQ96D03 193 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 MED4Q9NPJ6 270 aa16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF724A8MTY0 619 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 TPST2O60704 377 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 AKR7A3O95154 331 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 UQCRBP14927 111 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CXCR1P25024 350 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PRKAR1BP31321 381 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 GZMMP51124 257 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ART1P52961 327 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 H3F3AP84243 136 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PAMR1Q6UXH9 720 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 STK32CQ86UX6 486 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 TMEM99Q8N816 258 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 GPR32P1Q8NGA4 272 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 GP6Q9HCN6 339 aa16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 F8P00451 2351 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 LIPT2A6NK58 231 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 M0R3H8 397 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 KLF4O43474 513 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 LYZL6O75951 148 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 MFN2O95140 757 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 ATE1O95260 518 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PLAUP00749 431 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 SLC6A2P23975 617 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 IDUAP35475 653 aa16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TSTA3-211ENST00000529899 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms