RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528787.1

SSBP3-211, Transcript of single stranded DNA binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene SSBP3, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-211ENST00000528787 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 OR5B2Q96R09 309 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 FKRPQ9H9S5 495 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 NANSQ9NR45 359 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 CTPS2Q9NRF8 586 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 EMC3Q9P0I2 261 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 V9GYQ6 96 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.16□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 PCNX3Q9H6A9 2034 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 SVILO95425 2214 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 A0A1B0GTH9 108 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 TMEM229AB2RXF0 380 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 M0R3G1 203 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 FRS3O43559 492 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 SLC19A2O60779 497 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ENTPD5O75356 428 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 CCNB2O95067 398 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 IL2RAP01589 272 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 TPOP07202 933 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ANXA8P13928 327 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 FPR1P21462 350 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ENPP1P22413 925 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 UGT2B15P54855 530 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 CTBP2P56545 445 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 VLDLRP98155 873 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 PMP22Q01453 160 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ATP6AP1Q15904 470 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 RFX4Q33E94 735 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 PAQR6Q6TCH4 344 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 HMGN2P46Q86SG4 172 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ADGRG3Q86Y34 549 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 SMPDL3BQ92485 455 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 UCN2Q96RP3 112 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 TIMP4Q99727 224 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF426Q9BUY5 554 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 SLC6A15Q9H2J7 730 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 KIF17Q9P2E2 1029 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 MGAT4BQ9UQ53 548 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 RASD1Q9Y272 281 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF337Q9Y3M9 751 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.15□□□□□ -1.26
SSBP3-211ENST00000528787 MPDZO75970 2070 aa7.15□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.15□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.15□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 CD8B2A6NJW9 211 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 SLC22A20A6NK97 555 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 E9PLN8 166 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 G3V2T6 193 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 NCKAP5O14513 1909 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ADAM10O14672 748 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 LAMA5O15230 3695 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 OR10H3O60404 316 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 RCBTB2O95199 551 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 EPPINO95925 133 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ADAP00813 363 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 SAGP10523 405 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 PRG2P13727 222 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ACVR2AP27037 513 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 HTR2AP28223 471 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 SFTPDP35247 375 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 TIMP3P35625 211 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 DIO1P49895 249 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 LHX2P50458 406 aa7.14□□□□□ -1.27
SSBP3-211ENST00000528787 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms