RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	DSCR9	P59020	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GPX6	P59796	221 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	PSPH	P78330	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	DLG1	Q12959	904 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	TAB1	Q15750	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	NRF1	Q16656	503 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	PDIK1L	Q8N165	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	STEAP2	Q8NFT2	490 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF675	Q8TD23	568 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	HSD17B8	Q92506	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	VSTM2L	Q96N03	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	HBEGF	Q99075	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	MLST8	Q9BVC4	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	DSN1	Q9H410	356 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	B3GALT5	Q9Y2C3	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	C1orf226	A1L170	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	DPRX	A6NFQ7	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898		E7ESA3	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	UBXN8	O00124	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	LMX1B	O60663	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	KERA	O60938	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	PIAS1	O75925	651 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	KLK1	P06870	262 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SLC25A16	P16260	332 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SRD5A1	P18405	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	IGFBP5	P24593	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	FPR3	P25089	353 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	EVI2B	P34910	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	CTBP2	P56545	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	RAB10	P61026	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	PHEX	P78562	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	CFHR3	Q02985	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SEC23B	Q15437	767 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	LTB4R	Q15722	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	SGCB	Q16585	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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