RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496305.5

PHF20-215, Transcript of PHD finger protein 20, human

TSL 4

Gene PHF20, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20-215	ENST00000496305	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	HSDL2	Q6YN16	418 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	COQ2	Q96H96	371 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	COX16	Q9P0S2	106 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	TMCO1	Q9UM00	188 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		4.2	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	RIPK2	O43353	540 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	EMC8	O43402	210 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	MED7	O43513	233 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	DIRAS1	O95057	198 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	TIMP1	P01033	207 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	IGHG4	P01861	327 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	POU2F1	P14859	743 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	HTR1F	P30939	366 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CASP4	P49662	377 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SFT2D3	Q587I9	215 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	BFAR	Q9NZS9	450 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CHD4	Q14839	1912 aa		4.19	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305		A8MU10	97 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305		A8MXQ7	604 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ABCD4	O14678	606 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF19	P17023	458 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	OR2L13	Q8N349	312 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZBTB18	Q99592	522 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	COPS8	Q99627	209 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	RBKS	Q9H477	322 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305		V9GY05	133 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305		A0A0J9YXY3	114 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	DCTN6	O00399	190 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	IL1B	P01584	269 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	PCMT1	P22061	227 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	COX7A1	P24310	79 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CCR1	P32246	355 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	UBE2H	P62256	183 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SELENOT	P62341	195 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	FGF11	Q92914	225 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PHF20-215	ENST00000496305	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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