RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXD10P28358 340 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 HMOX2P30519 316 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNA8P32881 189 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 UQCRFS1P47985 274 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB10P61026 200 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 EIPR1Q53HC9 387 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMCX5Q6P1M9 558 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDCD3Q8IVD9 361 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR151Q8TDV0 419 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 F2RL3Q96RI0 385 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNA7Q96RP8 456 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 HCAR1Q9BXC0 346 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 IL22Q9GZX6 179 aa4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 REEP4Q9H6H4 257 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 AMBNQ9NP70 447 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.91□□□□□ -1.62
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RABGGTB-209ENST00000473406 RNF24Q9Y225 148 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC100653049A0A140TA62 436 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GUS0 222 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 INSIG1O15503 277 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 LATO43561 262 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 KRT34O76011 436 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 NTN1O95631 604 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 STAG3L2P0CL84 134 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ELK3P41970 407 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1D4P47884 311 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PKNOX1P55347 436 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS14P62263 151 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ITIH4Q14624 930 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 TPRX1Q8N7U7 411 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OR52I1Q8NGK6 324 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4A4PQ8NGN8 299 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 HTR3CQ8WXA8 447 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 UFD1Q92890 307 aa4.9□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 FGF22Q9HCT0 170 aa4.9□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 TGM6O95932 706 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBC1P01850 177 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 MBP02144 154 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 CDK4P11802 303 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 CD9P21926 228 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 RFX3P48380 749 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGDIBP52566 201 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 GRB7Q14451 532 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 LIN9Q5TKA1 542 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.89□□□□□ -1.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 RIMS3Q9UJD0 308 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 L3MBTL1Q9Y468 752 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1W2PPV4 95 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 B4DXG7 233 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGGTB-209ENST00000473406 E9PLD3 99 aa4.88□□□□□ -1.63
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