RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR10D3	Q8NH80	312 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	OSTF1	Q92882	214 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIB1	Q96RU8	372 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	C12orf10	Q9HB07	376 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		12.32	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	SULT2B1	O00204	365 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	FFAR1	O14842	300 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CXCL13	O43927	109 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR1	O75083	606 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPI	P06744	558 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACVR2A	P27037	513 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPIB	Q01892	262 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYBPH	Q13203	477 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52J3	Q8NH60	311 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	MPP4	Q96JB8	637 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF347	Q96SE7	839 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIP5K1A	Q99755	562 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHID1	Q9BWS9	393 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		12.31	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	GTF3C1	Q12789	2109 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLCA1	A8K7I4	914 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAMDEC1	O15204	470 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	LYPD3	O95274	346 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	THRB	P10828	461 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	FUT4	P22083	530 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	DIO1	P49895	249 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2B6	P58173	313 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	EGR4	Q05215	589 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCNI	Q14094	377 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAM2	Q15035	370 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGD3	Q5JSP0	725 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPTN	Q6XPR3	784 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	RRM2B	Q7LG56	351 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	STK35	Q8TDR2	534 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		12.3	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCL21	O00585	134 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNGT2	O14610	69 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRSS23	O95084	383 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	GADD45G	O95257	159 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	AHSA1	O95433	338 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYNGR4	O95473	234 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	FPR1	P21462	350 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBL	P22681	906 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	RRM2	P31350	389 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	IDUA	P35475	653 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	CA7	P43166	264 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	PON3	Q15166	354 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR7A5	Q15622	319 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	FJX1	Q86VR8	437 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM239	Q8WW34	195 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADGRG7	Q96K78	797 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPYC	Q99645	322 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	YY1AP1	Q9H869	796 aa		12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC22A20	A6NK97	555 aa		12.28	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRTM2	O43300	516 aa		12.28	□□□□□ -0.44

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