RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438265.5

RPE-211, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene RPE, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-211ENST00000438265 OIP5O43482 229 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 TNFSF13O75888 250 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 MFN2O95140 757 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 PCYT1AP49585 367 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 NUDT2P50583 147 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SESN3P58005 492 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 NCALDP61601 193 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SRYQ05066 204 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 RABL3Q5HYI8 236 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 WBP2NLQ6ICG8 309 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 VWA1Q6PCB0 445 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 C6orf89Q6UWU4 347 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 LUZP2Q86TE4 346 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 GGNQ86UU5 652 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 VRK2Q86Y07 508 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 PGAM4Q8N0Y7 254 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 OR2T12Q8NG77 320 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 FBXO27Q8NI29 283 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 ZNF583Q96ND8 569 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 ALG2Q9H553 416 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 GLRX2Q9NS18 164 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SLC13A4Q9UKG4 626 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 BAG5Q9UL15 447 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.4□□□□□ -1.22
RPE-211ENST00000438265 SLC22A20A6NK97 555 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CLDN24A6NM45 220 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SHISA8B8ZZ34 492 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DVL2O14641 736 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FZD7O75084 574 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CYP7B1O75881 506 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RCBTB2O95199 551 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PMS2P2O95744 297 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 LGI1O95970 557 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 EPXP11678 715 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 HSD17B1P14061 328 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CALB2P22676 271 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CTSSP25774 331 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC7A1P30825 629 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OPRM1P35372 400 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 KCNJ5P48544 419 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC7A2P52569 658 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RAC3P60763 192 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FAM27E3Q08E93 113 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MERTKQ12866 999 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FXNQ16595 210 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 NRF1Q16656 503 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SYT14P1Q58G82 188 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 C16orf89Q6UX73 402 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OLIG3Q7RTU3 272 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MICU2Q8IYU8 434 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 LILRA2Q8N149 483 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC43A2Q8N370 569 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR5M1Q8NGP8 315 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 OR10D3Q8NH80 312 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 BCAS4Q8TDM0 211 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC26A7Q8TE54 656 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 FAM222BQ8WU58 562 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 DDIT4LQ96D03 193 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 MBD6Q96DN6 1003 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 LRRC46Q96FV0 321 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 TRIM2Q9C040 744 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 ADAM19Q9H013 955 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 PIGMQ9H3S5 423 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 RNF122Q9H9V4 155 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.39□□□□□ -1.23
RPE-211ENST00000438265 CMTM6Q9NX76 183 aa7.39□□□□□ -1.23
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