RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MFSD13AQ14CX5 517 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MICAQ29983 383 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYT14P1Q58G82 188 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf140Q5VVS0 124 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 STK32CQ86UX6 486 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NRMQ8IXM6 262 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LILRA2Q8N149 483 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MEIOBQ8N635 442 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EXD3Q8N9H8 876 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NEIL3Q8TAT5 605 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5B2Q96R09 309 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC6A15Q9H2J7 730 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM185BQ9H7F4 350 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIGARQ9NQ88 270 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MGAT4BQ9UQ53 548 aa9.27□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A087WUU8 490 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM72A0PK05 275 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ENO4A6NNW6 628 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTLL8A6PVC2 850 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B4DXG7 233 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC14L5O43304 696 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAP00813 363 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MT-ATP6P00846 226 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGF2P01344 180 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2ABP04908 130 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFI30P13284 250 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTNP21246 168 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GSTM3P21266 225 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IST1P53990 364 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNCBQ16143 134 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTCAP3Q53RY4 240 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM69AQ5T7M9 428 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HMBOX1Q6NT76 420 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADGRG3Q86Y34 549 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GHDCQ8N2G8 530 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR4C15Q8NGM1 316 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POC1BQ8TC44 478 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIST1H2ACQ93077 130 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SARAFQ96BY9 339 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SGTBQ96EQ0 304 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLHL15Q96M94 604 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CIB1Q99828 191 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KLHDC3Q9BQ90 382 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ASPNQ9BXN1 380 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VNN3Q9NY84 501 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC6A5Q9Y345 797 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HEATR5AQ86XA9 2040 aa9.26□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SULT2B1O00204 365 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PIP5K1CO60331 668 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYPD3O95274 346 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHG3P01860 377 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 THY1P04216 161 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CELA3AP09093 270 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPS5P46782 204 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LIMS1P48059 325 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GFRA1P56159 465 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IL1RL1Q01638 556 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRKCDQ05655 676 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RBPJQ06330 500 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LY6DQ14210 128 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEC23BQ15437 767 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.25□□□□□ -0.93
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RFX4Q33E94 735 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms