RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 LRFN5Q96NI6 719 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB16Q96NS5 453 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR14A2Q96R54 314 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DPH1Q9BZG8 443 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D17Q9HA65 648 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK11Q9UBX7 282 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MCIDASD6RGH6 385 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ERI3O43414 337 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ALDOBP05062 364 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSM4P0C7M7 580 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SREBF2Q12772 1141 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FGFBP1Q14512 234 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NR0B2Q15466 257 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS42Q7Z5A4 293 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLITRK4Q8IW52 837 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFYVE19Q96K21 471 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00052Q96N35 136 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MIEF1Q9NQG6 463 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A087WV62 115 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KHKP50053 298 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM44Q2T9K0 475 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 WDFY1Q8IWB7 410 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 YIPF4Q9BSR8 244 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTRT3Q9BYD9 372 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GWA3 101 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM157AC9JC47 383 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM127O75204 238 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNGR1P15260 489 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD17B2P37059 387 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GDNFP39905 211 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 UBXN2BQ14CS0 331 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AANATQ16613 207 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PXDC1Q5TGL8 231 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF626Q68DY1 528 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5M10Q6IEU7 315 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NPSR1Q6W5P4 371 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MOB3CQ70IA8 216 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LINGO2Q7L985 606 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NRROSQ86YC3 692 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4C3Q8NH37 302 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF138Q8WVD3 245 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MOAP1Q96BY2 351 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 COPZ2Q9P299 210 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 NCDNQ9UBB6 729 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR160Q9UJ42 338 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HIF3AQ9Y2N7 669 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TUBAL3A6NHL2 446 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 IDSB3KWA1 339 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 AIPO00170 330 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HRKO00198 91 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CASKO14936 926 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LATO43561 262 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 BRINP1O60477 761 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CTNSO60931 367 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA3P12429 323 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1AP35813 382 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR3P46089 330 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00303Q3SY05 128 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 PHYHIPQ92561 330 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 CDS1Q92903 461 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 GAL3ST3Q96A11 431 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A4EQ96PG1 132 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C2Q9NZP2 312 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D29Q9UFV1 150 aa3.32□□□□□ -1.88
PGGT1B-203ENST00000419445 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
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