RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 KCNJ3P48549 501 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 KCNAB1Q14722 419 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 GXYLT1Q4G148 440 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 OR4Q3Q8NH05 313 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 MCHR1Q99705 422 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF576Q9H609 170 aa12□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 LTBP2Q14767 1821 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM129A0AVI4 362 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 CCSO14618 274 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TXNL1O43396 289 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 NPPBP16860 134 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 AGBL4Q5VU57 503 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZS52 159 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 AMER3Q8N944 861 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 ABHD4Q8TB40 342 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 SEMA4GQ9NTN9 838 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TTLL8A6PVC2 850 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 IFNGR2P38484 337 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 KCNJ5P48544 419 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM69Q5SWH9 247 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 FAM46CQ5VWP2 391 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TMUB2Q71RG4 321 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 CLRN3Q8NCR9 226 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 DENND4CQ5VZ89 1909 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 PI15O43692 258 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 S100A9P06702 114 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 S100A6P06703 90 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 EDNRAP25101 427 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 RIN1Q13671 783 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00303Q3SY05 128 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 PRRT3Q5FWE3 981 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 RNF44Q7L0R7 432 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 OR4N5Q8IXE1 308 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 KCT2Q8NC54 265 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 SMPDL3BQ92485 455 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 NKD1Q969G9 470 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM38AQ9H6F2 299 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 IFT22Q9H7X7 185 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 K7EQS6 105 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 PSMA3P25788 255 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 HMGA2P52926 109 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 GGTA1PQ4G0N0 100 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 CMIPQ8IY22 773 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 OR2T33Q8NG76 320 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 DRD2P14416 443 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 MAOBP27338 520 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 MPIP34949 423 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 SLC36A2Q495M3 483 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 FAM209BQ5JX69 171 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 VASNQ6EMK4 673 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 SLC17A9Q9BYT1 436 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 FN3KQ9H479 309 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 C2orf42Q9NWW7 574 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TPRP12270 2363 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 CDHR4A6H8M9 788 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 MT-ND5P03915 603 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 MAS1P04201 325 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 CENPAP49450 140 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 GMFBP60983 142 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 TGM3Q08188 693 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRN-202ENST00000409251 SCRN3Q0VDG4 424 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms